Protein ZmOrphan107 | |
---|---|
Information | |
Orphans Name: | ZmOrphan107 |
Species: | Maize |
Orphans Family: | Orphans |
Gene Name(Synonym): | |
Uniprot ID: | C0PI36 |
Subgenome: | 2 |
ZmOrphan107 is a protein in the Orphans family.
Overview of domains present in v5 transcripts | |||
---|---|---|---|
PF00931 | PF02671 | PF18052 | |
Zm00001eb091500_T001 | |||
Zm00001eb091500_T002 |
Gene ID | Type | MEME Logo | Sequence | FIMO | Position |
---|---|---|---|---|---|
Zm00001d004772 | DAPseq | sequence | fimo | position | |
Zm00001d004772 | DAPseq | sequence | fimo | position | |
Zm00001d004772 | ChIPseq | sequence | fimo | position | |
Zm00001d004772 | PChIPseq | sequence | fimo | position |
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Secondary Structure Color Code | |
---|---|
BEND | region with high backbone curvature without specific hydrogen bonding |
HELX_LH_PP_P | left-handed polyproline helix |
HELX_RH_3T_P | right-handed 3-10 helix |
HELX_RH_AL_P | right-handed alpha helix |
HELX_RH_PI_P | right-handed pi helix |
STRN | beta strand |
TURN_TY1_P | type I turn |
UNDETERMINED | no data available |
Domains Present | |
---|---|
PF18052 |
|
PF02671 |
|
PF00931 |
|
PF02671 |
|
PF02671 |
|
Hover here to show all domains |
CTTCAAAAATCAAGTTGATTATGCG...
CTTCAAAAATCAAGTTGATTATGCGGATACCGCAAACACTGCAAATTCGGTTGTTCCCTACCCTTCTAGAGTAATCTCTCCACACACACACTCACACGCTGCTGCCGGCTGCCCTCCTCCCGCCCCACTCGTCCCCTCCGAACCAAGTCCGATCCATCCATCCCCAAATTTCTCCTCTCAGCGCGTGGGGCAGTGGCGGCGGCAGCGTGGGCGCGCGGACCGCTACGGGCACGGGAGCAGCGGTGGCTGCGCAGGCAGCTGTCAGCATGCGGCATGGTGACTACGGGAGCCCAGGCGGCGCCGGTGCGGCTGCAGCCGGCGGCGGGCGACCGTGAGGCGGCTGCGGGAGCGGTGAAGTCCGGTGGCGCCTGCTTTGTTTTGTGTTCCTATTTTTGATTTGCGAAAGGATCCAAGAGAGAAAGGAGGGGGAGAAGGCGAGAATCCAAGACAAGAGCGAGCATGGAGTTTGCTACGGGTGCCATGGGTACCCTCCTCCCCAAGCTGGGCATGCTGCTGCAGGAAGAACTCCACCTGAAGAATAATGTGAAGGAGGGGATCAAGAGCCTCACTGCCGAGCTTGAGAGCATGCAAGCTGCACTTGTGAAGGTGTCTGACGTGCCATTAGACCAGCTTGACCCAAACGTCAAGATTTGGGCTAATGAAGTCAGGGGGCTGTCCTATGATATTGAGGACAGACTCGACTCCTTCAAGGTGCGCATGGAGGGTCTTGATTCAACCAAGCGCAAAACCATCATGGGATTCATCCAACAAACCCGTGGCTTGGTCACCAAGTTCAAGATTCGCCATGTAATATTTGATGACATTAAAGACTTCGGGAGCCAAGTAAAGGAGGTGAAGGAGCGGTATGACAGGTACAAGGTGCATGATGTTGTAGCTAATCCTATCGCAACCACAGTTGACCCTCGTCTCTTGGCTATGTATAACAAGGTTTCCGACCTTGTTGGCATTGACGAAGAAGCTAAGGAGCTAATGAATAATTTGTTTGAAGATGGTGACGAGCCAGCGAAAAAGATCAAGACAGTCTCTGTTGTTGGATTTGGAGGACTCGGCAAGACTACTCTTGTTAAAGCAGTCTATGACAAGGTTAAGAAGGAGTTTGATTGCAGTGCTTTTGTATCAATAGGTCAGAAATGTGATCTCAAGAAAGTTTTCAAGGACGTTCTTTATGATCTTGACAAGCAAAATCATGAAAATATCATTGCATCAGAAATGGATGAAAAACAACTCATTGATAAGCTACAGGAATTCCTTGCAGACAAGAGGTACTTGGTTGTTATTGATGACATATGGGATATATCAACATGGAAGCTGATTAGATGTGCTTTGGTGGAAAGTAACCCTGGAAGTAGAATAATCATAACTACTCGCATTTGTGAAGTTGCCAAAAAGGTTGGTGGTGTTTACAACAAGAAACCACTCTCTCTTGATGACTCCAAGACATTATTCTATACTAGAGTATTTGCTGGTGAAAGCATGAGTCTTGATAACATATCTGGTGAAGTGTGCAACAAAATCCTAAGAAAATGTGGTGGTGTGCCATTGTCCATCATTACGATAGCTAGTCTGCTTGTTGGTAAACAGAGGGAGGACTGGTCTAAGGTGTATGATTATATTGGTTTTGGGCATGAAGATAACGAGGTTATTGGGAACATGAGAAAGATATTAGCTTTCAGCTATTACAATCTACCTCCTTATCTAAAGACATGCTTATTGCACCTAAGCATATTTCCAGAAGATCACAAGATTGAGAAAAATTCATTGATATGGAGGTGGATAGCTGAAGGTTTTGTTATTGGCAGAGAAGAACTAGGGTTATTTGAGGTTGGAGAGAGCTATTTCAATGAGCTCATAAATAGAAGCATGATCCGGTGGATAGAGCTCTCTAGTAGAAGCAAGATTCGAGATGGTTGTGGTATTCATGATATGGTGCTTGATCTTATCCGCACTTTGTCAGGTGAAGTAAACTTGGTCACGGTATCAGATGTGGAGCAGCAGTGTACCACATCATCATCATATTCACCAGTCAGAAGCATTAGCGCTCGAAGATTAGCCTTCCACAAAAAAAGAAGCATTGAACACAACCCTGGCACAGAAATAGGACAGGTGAGATCATTCAATGCTTTCAACTGCTCTGGTAGTAGGATGCCCCGACTTTTAAGCTTCAGGGTCTTACGTGTACTAGCTCTGGAGAACTGTAATTTCTCAGCAGGAAACTGTTGCCTTGGAAATATTGGCAAATTGCATCAGCTGAGGTACCTAGGGCTAGTGGAGACATCCATTCGTGACGACTTGCTGCCTGGAGAAACAGGACACCTCAAGTTTCTGCAGACACTAGATGTAAGACGAAGTGGCATAAAAATATTGCCAGCGTCTGTTGGTGAGCTAATGAAACTGATGTGCCTGCGTGCTACCGAGGGCACAAGGATGATGGCCGAGATTGGGAAGCTGGCGTCACTGGAAGAGCTTGAGGTACACTCTGTGGACAAGTCGCCAAACTTCGCCACGGGGCTGGGGCAGCTAACCAAGGTGAGGGTGCTTGAGATCCATTTCGACGAAATGGACGAGAGCACAGAGAAGGCTCTCATGGAGTCCCTGCGCAACCTGCGGAAAATCCAGAGTCTGCAGATATGGTCCAAGAAGGAGAGGACAATTGACCTTGGCGGCTTGTTGGAAGACTGGACGCCAACCCCTTCAGATCTCCGTCAACTGATGCTGTGTGGCATCCATTTGCCCAGGCGTCCGTCATGGATTGATCCCTCATGTGTCCCGCTCCTCTCGTACTTGTCGCTCACGGTCCAGGCCGTGCAAGTGCAGGATCTAGAAATCCTCGGGAGGCTGCCGTTGCTCAGCTACCTCTACATCTGGAGTGAGGGCATCAACTGCTTATCCTATACTGCTACCAGCAGAGACGAGTTTCAGAATCTGAGACATCTGGACACAAACCTGGAGATCATGTGTGGACAGCAGGGAGCACTGCCTATGGTTGAGAAGTTGACATGCCGTGCCAGCATGGGGAAGTATGTTGCCTTTGCCAGGAGCAGCATGCCTTTCGACGATGGCAGCGTGGTGAATCCTGCTACTGTTGCTGAGGCAGAATTGCCAGTAATTCTACCTTTGGACATTGGCTGGCCCGTGAACATGCCTTGCCTCCGGGGCATCACCTATTTGCTGGATTACCAGGACTGCAGTGCCAAGGAGTGGGCTCATGTGGAGACATTGCTCTTGCACGTGAGAAAAATCCACCCCAACTGTCCACCCTTCCGAATCAAAAAGAACTGCAGAGACAAGAAGATTACCTTGATCGACGCATTCAGCTACCTTGAAGCTGTCAAGGATGTGTTCAAGGGCAACCCCTCCAAATACTCGGAGTTTTTTGATCTCATGATTGATTACAAGAGAGACAGAATCAAAATCAAAGATGTGATCATCCGTCTCAAGACCCTATTTACTGGACATGATCCTAATCTCATCCTTGACTTCAGCGTCTTCCTGCCCAGGGAGTGGGCCATCACTCTCGGGGACCTGTAGAAGAAGCCCCTTCATGATCGATTCTAGCTAGGCCATCACCCATTTAGTTAACAAGACCAAGTCGGGATGACGGCGATGGATCTGATCATGTTACCGGCACAAATGGCGAAGAAGAGGACGATACCCATGAAGCGTAATATGCAATCCCTGTCACCAGTGGAGGATCTTTGCTTCAGTTAATTCATTGTCAAGGATAATCTTGTTTACTTAGTCGTTGTGCTTAGGGCCTGTTTATTTAGGGTGTGTTTGGTTTGACTTTTGGCTTTTGGCTTTTGCCCCCTAAAAGCCAAAAGCCAACCAAAGGGTTGGATCTAAGAAGCAGCTTTTTCTAAAAGCTGACTTTCTCACAGTGCAAATCTGAAAGCACACCTGAACCTGCTTTTAGTGGCTTTTCGGATGGAATTGTGAAAACATATATCGAAGAACTTTGAACGACTTTTAGTGGTTTCCACCAAATGGTTTTTAGCTTTTTAACGGCTCACAGCCTACAGCAGCTTTTTCCACAGCTCACAGCCCACAGCAACTTTTTTCACAGCCACAGCCCAACCAAACAGACCCTTACCCCCAGATTATATAATCTGGATTAAATAATCCTAAGAGGCAAACAAACAGTCCAGCTTATTTGCCCAGATTATGGGCCTGTTTGTTTACCCCCATGGATTATATAATCTGGATTATTTTTGGAGGATTATATAATCTGGATTATATAATCTGGATTATATAATCTGAGTAGTCCTGTTTGTTTACCCAGATTATTTGAGTTGTTAATAGGATTCTTTTGTATGAGGAAGACAAGAATACCCTCTATATTTGTACTAGGTTGAAACTCATATATGAAAAAAAATAT
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